أُقفل الموقع ثم أهمل عقب حرب الأيام الستة التي اندلعت سنة 1967. وكان الجيش الإسرائيلي قد وضع ألغاماً في كافة أنحاء المنطقة وأنشأ بوابة كهربائية لمنع التسلل من الأردن.
أُعلن المكان “منطقة عسكرية مغلقة”، وأُخليت أديرة المنطقة. وفي الثمانينيات، استؤنفت الزيارات المحدودة والمنظمة بدقة من قبل الجيش الإسرائيلي. إذاً، استؤنف الذهاب إلى الموقع بخاصة في عيد الغطاس.
عملية إعادة الفتح هي نتيجة إرادة سياسية. فقد اهتم وزير السياحة الإسرائيلي بترميم الموقع. لكن الاحتفال بإعادة فتحه حصل بشكل سري للغاية.
ووفقاً لبعض الخبراء، فإن الموقع الأصلي لمعمودية يسوع على يد القديس يوحنا المعمدان كائن على الضفة الشرقية لنهر الأردن، من الجهة الأردنية. وقد سمحت الحفريات الأثرية بالعثور على كابيلات قديمة جداً. فضلاً عن ذلك، يتحدث إنجيل القديس يوحنا عن بيت عنيا وراء نهر الأردن. إشارة إلى أن هذا الموقع الأردني زاره يوحنا بولس الثاني سنة 2000 وبندكتس السادس عشر سنة 2009.
