لقد ظلّ لسنوات طويلة يراودنا حلم إنشاء مجلس لكنائس مصر. يسعى لتعميق المحبّة وحياة الشركة والتعاون بين الكنائس بكل مذاهبها في مصر. ولتدعيم العمل المسيحي وخدمة الوطنيّة الأصليّة.

هذا الأمل الذي بدأ في عهد مثلث الرحمات قداسة البابا شنوده الثالث وتناقش فيه مع رؤساء الكنائس، وحازت الفكرة رضاه في أبريل 2010، وأعلن عن هذا المشروع في اللقاء الأسبوعيّ بالكاتدرائيّة المرقسيّة مساء الأربعاء 15 فبراير 2012 قبيل نياحة قداسته.

وتابع رؤساء الكنائس الخمس الحاليون صاحب القداسة البابا الأنبا تواضروس الثاني، وحضره القس الدكتور صفوت البياضي، وصاحب الغبطة الأنبا ابراهيم اسحق، وصاحب الغبطة البابا البطريرك ثيودوروس الثاني، ونيافة المطران الدكتور منير حنا مشروع إنشاء "مجلس كنائس مصر" والذي يشكرون الرب على تحقيقه.

ويعتبر هذا المجلس مجلساً كنسيّاً، يعمل على خدمة الكنائس والوطن، ولا يعمل في السياسة ولا يتدخل فيها.

كما أن (مجلس كنائس مصر) يتعاون مع المجالس المسكونيّة المسيحيّة والمتفق عليها حاليّاً من الجميع وهي: مجلس الكنائس العالمي، مجلس كنائس الشرق الأوسط، مجلس كنائس كل أفريقيا.

واليوم 18 فبراير 2013 تمّ الإتفاق بين رؤساء الكنائس: الكنيسة القبطيّة الأرثوذكسيّة والطائفة الإنجيليّة (الكنائس الإنجيليّة) والكنيسة الكاثوليكيّة وكنيسة الروم الأرثوذكس والكنيسة الأسقفيّة على إنشاء هذا المجلس الكنسي تدعيماً للمحبة والتعاون المستمر والمثمر والتشاور والحوار ولخدمة مصر.

ويصلي رؤساء الكنائس لكي يبارك الرب عمل ونشاط مجلس كنائس مصر.